new entity = GetMaxEntities();
while (entity > MaxClients)
{
  if (IsValidEntity(entity))
  {
    // ..
  }

  --entity;
}

#define MAX_POINTS 300    // ограничение вейпоинтов

int count;   //кол-во созданных вейпоинтов
float point[count][3];  сам вейпоинт, его положение(массив)

for(new i = 1; i < count++i){
point[i]........
.......
....

for(new i = 1; i < MAX_ENT; ++i){ только заметил - здесь можно по моему начинать не с 1(1-32 это ведь игроки) взять MaxClients, правда не пробовал, попробую.
if(IsValidEntity(i)){
GetEdictClassname(i, classname, sizeof(classname));
if(StrEqual(classname, "class_waypoint", true)){
GetEntPropVector(i, Prop_Send, "m_vecOrigin", point_pos);
.....
..

new Handle:g_hAr;

public OnPluginStart()
{
   g_hAr = CreateArray(1);
   HookEvent("round_start", round_start, EventHookMode_PostNoCopy);
}

public round_start(Handle:event, const String:name[], bool:silent)
{
   ClearArray(g_hAr);
}

создание_ent()
{
   new ent = CreateEntityByName(...);

   //
   PushArrayCell(g_hAr, EntIndexToEntRef(ent));
   //

   ...
}

цикл_по_созданным_ent()
{
   new index = GetArraySize(g_hAr);
   decl ent;

   while (--index != -1)
   {
      if ((ent = EntRefToEntIndex(GetArrayCell(g_hAr, index))) > MaxClients)
      {
         ...
      }
   }
}

new Handle:g_hTo4ka;  // список точек (координаты)
new Handle:g_hTo4kaName;    // имя точки (для примера, как хранить дополнительную инфу)

public OnPluginStart()
{
    g_hTo4ka = CreateArray(3);
    g_hTo4kaName = CreateArray(50);

    HookEvent("round_start", round_start, EventHookMode_PostNoCopy);
}

// Возможно нужен не round_start, а OnMapStart.
public round_start(Handle:event, const String:name[], bool:silent)
{
    ClearArray(g_hTo4ka);
    ClearArray(g_hTo4kaName);
}

создание_ent()
{
    new ent = CreateEntityByName(...);

    //
    new Float:to4ka[3] = Float:{1.0, 2.0, 3.0};
    new String:to4ka_name[] = "test";

    PushArrayArray(g_hTo4ka, to4ka, 3);
    PushArrayString(g_hTo4kaName, to4ka_name);
    //
    
    // И когда у нас есть индекс танка (TankEnt) и надо найти ближайшую точку:
    decl Float:result_pos[3], String:to4ka_name[50];
    if (ПолучитьКоординатыБлижайшейТочки(TankEnt, result_pos, to4ka_name))
    {
        PrintToChatAll("Ближайшая точка '%s' (%.1f %.1f %.1f)", to4ka_name, result_pos[0], result_pos[1], result_pos[2]);
    }

    ...
}

stock bool:ПолучитьКоординатыБлижайшейТочки(TankEnt, Float:result_pos[3], String:to4ka_name[50])
{
    decl Float:TankEnt_pos[3];
    GetEntPropVector(TankEnt, Prop_Data, "m_vecAbsOrigin", TankEnt_pos);

    new index = GetArraySize(g_hTo4ka);
    new Float:fDistMin = 0.0;
    decl Float:x_pos[3], Float:fDist;

    while (--index != -1)
    {
        GetArrayArray(g_hTo4ka, index, x_pos, 3);
        if ((fDist = GetVectorDistance(x_pos, TankEnt_pos)) < fDistMin || fDistMin == 0.0)
        {
            fDistMin = fDist;
            result_pos[0] = x_pos[0];
            result_pos[1] = x_pos[1];
            result_pos[2] = x_pos[2];
            GetArrayString(g_hTo4kaName, index, to4ka_name, 50);
        }
    }
    
    return fDistMin != 0.0;
}

1.691101 -783.103393 135.643127 0.000000 1.813337 0.000000 "classname" "class_waypoint"
-277.506530 -770.624694 75.003135 0.000000 1.813337 0.000000 "classname" "class_waypoint"

278.137084 2390.010253 -126.306930 0.000000 85.303268 0.000000 class_gr_wpbombplb  //бомбплэйс В  
385.627166 2397.619384 -125.687614 0.000000 85.303268 0.000000 class_gr_wpbombplc  //бомбплэйс С
288.481933 2272.243652 -126.499694 0.000000 85.303268 0.000000 class_gr_wpkemp      // кемперский
156.917434 2405.375000 -126.775321 0.000000 95.269386 0.000000 class_gr_wpnrm        // нормальный
450.335510 2451.042724 -115.058654 0.000000 95.269386 0.000000 class_gr_wpnrm        // нормальный

new String:spawnClassName[MAX_POINTS][26];  // это для class_gr_wpbombplc (строкой)

char buffer[256];
new String:parts[7][26];    // можно конечно по новому char, но пока так сделал.
while (!IsEndOfFile(file) && ReadFileLine(file, buffer, sizeof(buffer))){
ExplodeString(buffer, " ", parts, 7, 26);
spawnPositions[iSpawnWaipointCount][0] = StringToFloat(parts[0]);
spawnPositions[iSpawnWaipointCount][1] = StringToFloat(parts[1]);
spawnPositions[iSpawnWaipointCount][2] = StringToFloat(parts[2]);
spawnAngles[iSpawnWaipointCount][0]    = StringToFloat(parts[3]);
spawnAngles[iSpawnWaipointCount][1]    = StringToFloat(parts[4]);
spawnAngles[iSpawnWaipointCount][2]    = StringToFloat(parts[5]);         // здесь из строки конвертирую в float
spawnClassName[iSpawnWaipointCount]    = parts[6];                    // косяк, по моему, здесь. Возможно я не правильно понял принцип работы ExplodeString.
iSpawnWaipointCount++;
}

spawnClassName[iSpawnWaipointCount] = "class_gr_wpnrm";

for (int i = 0; i < iSpawnWaipointCount; i++){
float spawnPosition[3];
AddVectors(spawnPositions[i], spawnPointOffset, spawnPosition);   //размер свечения, в высоту.

if (StrEqual(spawnClassName[i], "class_gr_wpnrm", false)){                    // И вот здесь не сравниваются 2 строки, они непохожи. Не пойму что за .....
TE_SetupGlowSprite(spawnPosition, glowSpriteNormal, 1.0, 0.5, 255);
TE_SendToAll();
}
......
....

TrimString(parts[6]);
strcopy(spawnClassName[iSpawnWaipointCount], sizeof(spawnClassName[]), parts[6]);